Вибрация при разгоне, начиная с 40км/ч. Иногда сильная. Ходовка перебрана. Может кто

Балансировку колёс сделайте. И проверьте покрышки на наличие грыж, застрявших в протекторе камней. А диски на налипшую грязь, она тоже даёт дисбаланс при вращении колёс.

Все сделано, ходовка перебрана. Колеса отбалансированы, резина хорошая. Остаются подозрения на автомат.

Сомневаюсь... Если она у вас 4WD проверьте крестовины кардана и подвесной. Проверьте состояние шрусов.
Коробку рассматривайте в самую последнюю очередь...

дело в том, что все уже проверено по несколько раз у разных специалистов. Все нормально: кардан, крестовины, гранаты, привода. Не знаю на что думать уже. Что еще проверить?

Если всё проверено специалистами, ещё и несколько раз, значит всё у вас в порядке... или такие специалисты.
Попробуйте обратиться в нормальный Сервис, где за деньги вам всё проверят, сделают заключение, и дадут рекомендации. Через интернет, дистанционно, мы можем помочь вам только советом, а его я вам уже дал.
Если Сервис не может найти устранить неисправность, значит надо обращаться в другой Сервис. Сейчас во всех регионах есть нормальные, не гаражные, СТО, с приемлемыми ценами и гарантией на выполненные работы.
Например, федеральная сеть ФИТ-Сервис: http://fitauto.ru Посмотрите, возможно у вас он тоже есть. Записаться на ТО можно прямо на сайте.