Подскажите для чего на крышке багажника вторая кнопка?

Это бесключевой доступ. Машину можно открыть с кнопки либо с водительской или пассажирской двери, либо с багажника. Ключ должен быть поблизости, например, в кармане. Закрыть можно также, нажав на кнопку.
Если подробнее, то в Тойоте бесключевой доступ устроен очень интересно. Для открытия дверей кнопку нажимать не нужно, т. е. и багажник или дверь вы можете открыть, просто потянув за ручку открытия (сенсорная кнопка задней двери), а чтобы закрыть машину, необходимо нажать на кнопку бесключевого доступа.